MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC1

Total Repeats: 5826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017078	TAAC	2	8	11	18	50 %	25 %	0 %	25 %	383760689
2	NC_017078	CAC	3	9	30	38	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760689
3	NC_017078	AAAG	2	8	81	88	75 %	0 %	25 %	0 %	383760689
4	NC_017078	TGA	2	6	111	116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760689
5	NC_017078	AGG	2	6	140	145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760689
6	NC_017078	AAG	2	6	166	171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760689
7	NC_017078	CAA	3	9	198	206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760689
8	NC_017078	GCG	2	6	209	214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760689
9	NC_017078	AAC	2	6	222	227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760689
10	NC_017078	AGC	2	6	234	239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760689
11	NC_017078	CCT	2	6	249	254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760689
12	NC_017078	AAG	2	6	259	264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760689
13	NC_017078	TGA	2	6	278	283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760689
14	NC_017078	CTG	2	6	373	378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760689
15	NC_017078	ACT	2	6	434	439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760689
16	NC_017078	GGT	2	6	526	531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760689
17	NC_017078	ATC	2	6	547	552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760689
18	NC_017078	CAT	2	6	558	563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760689
19	NC_017078	GAA	2	6	565	570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760689
20	NC_017078	AAC	2	6	625	630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760689
21	NC_017078	TCA	2	6	665	670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760689
22	NC_017078	CAC	2	6	732	737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760689
23	NC_017078	AGC	2	6	743	748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760689
24	NC_017078	TCC	2	6	818	823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760689
25	NC_017078	TCA	2	6	887	892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760689
26	NC_017078	CCTG	2	8	931	938	0 %	25 %	25 %	50 %	383760689
27	NC_017078	AT	3	6	954	959	50 %	50 %	0 %	0 %	383760689
28	NC_017078	TGA	2	6	969	974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760689
29	NC_017078	GGT	2	6	975	980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760689
30	NC_017078	AGC	2	6	992	997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760689
31	NC_017078	AAT	2	6	1004	1009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760690
32	NC_017078	ATG	2	6	1013	1018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760690
33	NC_017078	A	6	6	1045	1050	100 %	0 %	0 %	0 %	383760690
34	NC_017078	TCC	2	6	1061	1066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760690
35	NC_017078	GAA	2	6	1100	1105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760690
36	NC_017078	GGC	2	6	1125	1130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760690
37	NC_017078	AGC	2	6	1189	1194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760690
38	NC_017078	CAG	2	6	1376	1381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760690
39	NC_017078	GCC	2	6	1413	1418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760690
40	NC_017078	TGACC	2	10	1471	1480	20 %	20 %	20 %	40 %	383760690
41	NC_017078	AAG	2	6	1643	1648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760690
42	NC_017078	AGC	2	6	1675	1680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760690
43	NC_017078	CGG	2	6	1704	1709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760690
44	NC_017078	A	6	6	1782	1787	100 %	0 %	0 %	0 %	383760690
45	NC_017078	GCC	2	6	1802	1807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760690
46	NC_017078	ATG	2	6	1815	1820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760690
47	NC_017078	TCA	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760690
48	NC_017078	GCCA	2	8	1934	1941	25 %	0 %	25 %	50 %	383760690
49	NC_017078	GAA	2	6	1988	1993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760690
50	NC_017078	CCAT	2	8	2010	2017	25 %	25 %	0 %	50 %	383760690
51	NC_017078	CAA	2	6	2068	2073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760690
52	NC_017078	CAA	2	6	2092	2097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760690
53	NC_017078	TCA	2	6	2109	2114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760690
54	NC_017078	GAAACC	2	12	2126	2137	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383760690
55	NC_017078	TGG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017078	TTTA	2	8	2291	2298	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017078	TTAT	2	8	2311	2318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017078	C	6	6	2350	2355	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59	NC_017078	ACC	2	6	2383	2388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017078	AGA	2	6	2430	2435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017078	ACC	2	6	2437	2442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017078	A	7	7	2475	2481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017078	CAC	2	6	2558	2563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017078	CAC	2	6	2613	2618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017078	CAC	2	6	2685	2690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017078	TCC	2	6	2710	2715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017078	A	6	6	2742	2747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017078	C	6	6	2794	2799	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_017078	TA	4	8	2814	2821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017078	TTA	2	6	2822	2827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017078	TAT	2	6	2834	2839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017078	ATATA	2	10	2846	2855	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017078	TGT	2	6	2869	2874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017078	CCA	2	6	2897	2902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017078	TAA	2	6	2912	2917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017078	TA	6	12	2945	2956	50 %	50 %	0 %	0 %	383760691
77	NC_017078	ATGAA	2	10	3080	3089	60 %	20 %	20 %	0 %	383760691
78	NC_017078	AATAT	2	10	3155	3164	60 %	40 %	0 %	0 %	383760691
79	NC_017078	TCAACA	2	12	3185	3196	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383760691
80	NC_017078	CAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760691
81	NC_017078	ATCA	2	8	3367	3374	50 %	25 %	0 %	25 %	383760691
82	NC_017078	TGG	2	6	3476	3481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760691
83	NC_017078	ATCG	2	8	3520	3527	25 %	25 %	25 %	25 %	383760691
84	NC_017078	A	6	6	3598	3603	100 %	0 %	0 %	0 %	383760691
85	NC_017078	CAG	2	6	3610	3615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760691
86	NC_017078	AGC	2	6	3675	3680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760691
87	NC_017078	GTA	2	6	3742	3747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760691
88	NC_017078	ACT	2	6	3748	3753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760691
89	NC_017078	CGA	2	6	3798	3803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760691
90	NC_017078	TCC	2	6	3808	3813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760691
91	NC_017078	TCA	2	6	3848	3853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760691
92	NC_017078	TTA	2	6	3891	3896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760691
93	NC_017078	A	6	6	3910	3915	100 %	0 %	0 %	0 %	383760691
94	NC_017078	A	6	6	3967	3972	100 %	0 %	0 %	0 %	383760691
95	NC_017078	CGG	2	6	3988	3993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760691
96	NC_017078	AGA	2	6	4046	4051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760691
97	NC_017078	GGA	2	6	4065	4070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760691
98	NC_017078	AAT	2	6	4090	4095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760691
99	NC_017078	GCT	2	6	4131	4136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760691
100	NC_017078	AAG	2	6	4333	4338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017078	TGT	2	6	4361	4366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017078	T	6	6	4375	4380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017078	TAA	2	6	4439	4444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017078	AGA	2	6	4446	4451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017078	GAG	2	6	4457	4462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017078	GCT	2	6	4586	4591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760692
107	NC_017078	GTG	2	6	4599	4604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760692
108	NC_017078	CGG	2	6	4713	4718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760692
109	NC_017078	GATG	2	8	4726	4733	25 %	25 %	50 %	0 %	383760692
110	NC_017078	TGC	2	6	4756	4761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760692
111	NC_017078	GGA	2	6	4783	4788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760692
112	NC_017078	ATC	2	6	4902	4907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760692
113	NC_017078	ATG	2	6	4919	4924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760692
114	NC_017078	GAA	2	6	5062	5067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760692
115	NC_017078	AAGGC	2	10	5070	5079	40 %	0 %	40 %	20 %	383760692
116	NC_017078	GGC	2	6	5099	5104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760692
117	NC_017078	AAGGGC	2	12	5237	5248	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	383760692
118	NC_017078	AGC	2	6	5256	5261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760692
119	NC_017078	TGG	2	6	5316	5321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760692
120	NC_017078	GAA	2	6	5360	5365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760692
121	NC_017078	GCA	2	6	5380	5385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760692
122	NC_017078	GCA	2	6	5403	5408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760692
123	NC_017078	TGA	2	6	5425	5430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760692
124	NC_017078	CAGG	2	8	5558	5565	25 %	0 %	50 %	25 %	383760692
125	NC_017078	GATCA	2	10	5645	5654	40 %	20 %	20 %	20 %	383760692
126	NC_017078	CAAC	2	8	5695	5702	50 %	0 %	0 %	50 %	383760692
127	NC_017078	TGC	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760692
128	NC_017078	GAA	3	9	5714	5722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760692
129	NC_017078	CAG	2	6	5792	5797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017078	CCT	2	6	5808	5813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_017078	AAT	2	6	5885	5890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017078	TAT	2	6	5907	5912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017078	GAAT	2	8	5962	5969	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017078	AT	3	6	5978	5983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017078	GGA	2	6	6006	6011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017078	AAT	2	6	6021	6026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760693
137	NC_017078	AGA	2	6	6031	6036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760693
138	NC_017078	ATC	2	6	6051	6056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760693
139	NC_017078	G	6	6	6101	6106	0 %	0 %	100 %	0 %	383760693
140	NC_017078	GCC	2	6	6117	6122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760693
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154	NC_017078	TGC	2	6	6755	6760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760693
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265	NC_017078	GAAAA	2	10	11861	11870	80 %	0 %	20 %	0 %	383760698
266	NC_017078	GCA	2	6	11873	11878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760698
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396	NC_017078	GAA	2	6	18012	18017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760703
397	NC_017078	A	6	6	18028	18033	100 %	0 %	0 %	0 %	383760703
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399	NC_017078	AGG	2	6	18134	18139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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